Thomas Fort, doctorant COTE au sein de l’unité BioGeCo

Fils de vignerons, Thomas a toujours été attiré par le monde de la vigne et du vin. C’est pourtant vers la biologie et l’écologie qu’il se dirige en licence et première année de Master à Toulouse. Suite à son Master 2 en biodiversité, écologie et évolution à Montpellier, il ne trouve pas de thèse. « Mon CV péchait par manque de spécialisation » avoue-t-il, ce qui le mène de nouveau à Toulouse pour un 2^ème Master 2 en biostatistiques et modélisation des systèmes écologiques.

C’est au détour d’un séminaire qu’il rencontre ses futures directrices de thèse, Cécile Robin et Corinne Vacher… en quête d’un doctorant. « Le courant est passé immédiatement » et le sujet proposé – transfert de microorganismes de la forêt vers la vigne - lui plait immédiatement par la dimension pluridisciplinaire du projet, son aspect novateur et la vigne, qui fait son retour dans sa vie.

Son travail : récolter des feuilles dans les parcelles et les analyser en laboratoire. C’est complexe, les microorganismes (bactéries, champignons, etc.) qu’il étudie ne sont pas identifiables à l’œil nu ou même au microscope ! C’est grâce à leur ADN qu’il les différencie. Ce procédé de métagénomique permet à partir d’un mélange d’ADN, de déterminer la présence de certaines espèces dont on connait les caractéristiques génétiques. Il s’intéresse aussi à la structuration de ces communautés de microorganismes en fonction du paysage, en la liant  par exemple à la taille de la forêt environnante.

« Pour moi être thésard ce n’est pas seulement se focaliser sur son projet de recherche » déclare-t-il en suivant. Thomas veut absolument profiter de toutes les opportunités offertes par le statut : enseignement, modules d’ouverture pour enrichir sa culture scientifique et générale, mobilité internationale… Il accorde aussi une grande importance à la médiation et au transfert du savoir scientifique.

L’école d’été du LabEx COTE

« J’étais à la recherche de quelque chose de général, d’un aperçu de tout ce qu’il se faisait au LabEx » explique le doctorant. Il estime avoir pu y saisir « l’esprit de la recherche scientifique au sein du LabEx » et ajoute avoir  beaucoup aimé la partie sciences sociales transverse à tous les écosystèmes.

En dehors des cours, « beaucoup d’échanges, une réelle dynamique de groupe ». Les discussions ont souvent été centrées sur la science, la méthodologie, les statistiques... le tout dans une ambiance décontractée. « Découvrir autant de cultures, de pays et de langues a été formidable » déclare-t-il rêveur. Un réel bon au niveau social, pratique de l’anglais et création de contacts pour le futur.

[1] BIOdiversité, GEnes & COmmunautés

[2] Santé et Agroécologie du VignoblE

[3] Interaction Sol Plante Atmosphère