Université de Bordeaux
LabEx COTECluster of Excellence
Cluster of excellence

PINELINE - Développement d'une base de données relative aux micro-variations radiales du tronc de pin maritime associées aux variations environnementales (UMR Biogeco)

Le projet PINELINE est une plateforme « Base de données » pour stocker et rendre facilement accessible des données de phénotypage haut débit de micro-variation radiale et des données environnementales, pour des populations de pin maritime. Ces données de phénotypage, liées au statut hydrique de l’arbre, sont utilisées depuis 2011 par des généticiens de BIOGECO comme indicateur de la réponse des arbres aux contraintes abiotiques.  Elles  sont  enregistrées  sur  le  terrain  toutes  les  5  minutes  grâce  à  des dendromètres électroniques fixés aux arbres, parallèlement aux variables environnementales (humidité  du  sol,  hauteur  de  la  nappe,  température, rayonnement incident) enregistrées à la même fréquence.

Notre projet PINELINE a deux objectifs principaux : i/ la construction d’une base de données spécifiquement dédiée à ce type de données phénotypiques et environnementales à haut-débit, ii/ permettre son accessibilité à la communauté scientifique grâce à une interface adaptée. PINELINE participera aussi au maintien des dispositifs de suivi au champ, mis en place dans le cadre d’autres projets terminé (projet FEDER Abiogen) ou en cours (projet région Fortius, projet ANR WUETree). PINELINE sera conçu pour être interopérable avec d’autres bases de données existantes comme Pinus Portal pour les données génétiques. Cette plateforme constituera un outil à la fois pour les chercheurs de l’unité BIOGECO et du Labex COTE, mais aussi pour des chercheurs extérieurs au niveau national ou international dont les thématiques de recherches concernent l’adaptation des arbres aux changements climatiques (réseau européen STReESS COST Action : http://streess-cost.eu/).

Figure dans les rubriques
Projets soutenus


HAUT